La Galleria Borghese conserva opere somme dei maggiori artisti del Cinquecento e Seicento; per citarne solo alcune, la Deposizione di Raffaello, la Paolina Bonaparte di Canova, la Danae di Correggio, l ’Amor Sacro e l’Amor Profano di Tiziano, la Madonna dei Palafrenieri di Caravaggio, Apollo e Dafne di Bernini, Venere e Amore di Cranach, la Caccia di Diana di Domenichino.

Gran parte di queste opere - le più importanti della collezione e capolavori fondamentali per il catalogo di ciascun autore - è inamovibile dalla propria sede. Sono infatti troppo delicate, troppo grandi o su supporto troppo fragile per spostarsi; è perciò impossibile il trasferimento a quelle mostre temporanee che in giro per il mondo vogliono approfondire l’attività pittorica di questi artisti.

Il ciclo di mostre vuole approfondire la conoscenza che studiosi e grande pubblico hanno di autori, anche molto noti, accostando per la prima volta ai capolavori della collezione Borghese prestigiosi prestiti dalle maggiori istituzioni museali del mondo

La prima delle dieci grandi mostre del programma espositivo, dedicata alla opera di Raffaello, si è svolta con grande successo di pubblico, nel periodo tra maggio e settembre 2006. Una importante serie di disegni arricchiva la mostra e dava la possibilità di esplorare il processo creativo del grande pittore.
Da ottobre del 2007, fino a febbraio 2008, la Galleria Borghese ha ospitato la seconda grande mostra che prendeva in esame l'opera di Antonio Canova. Insieme quindi alla Paolina Borghese, opera "padrona di casa", la Galleria ha avuto l'onore di ospitare circa 60 opere di cui 18 sculture.
La terza mostra, che si è svolta da maggio ad ottobre 2008, prendeva in esame il delicato rapporto tra Correggio e l'Antico. Una serie di paralleli meditati per analizzare ed approfondire l'opera del grande pittore cinquenectesco e verificare le sue ispirazioni dall'antico.

Il 1 ottobre 2009, si apre la quarta grande mostra dedicata a Caravaggio e Bacon, cui farà seguito nel 2010 Dosso Dossi, Tiziano (2011), Cranach (2012), Bernini (2013), Domenichino (2014), per chiudere nel 2015 con la grande mostra sui Borghese e l’Antico.